菲律宾外交部网站11月28日发表声明称，菲律宾将拒绝在中国新版护照上盖印签证，要改在另外的签证申请表单上盖章，此举是为避免菲通过护照盖章而承认中国在南海划定的“九段线”。

此前，法新社11月27日报道，越南首都河内的内排国际机场入境处负责人27日表示，越南拒绝在新版中国护照的入境签证上盖章。报道称，越南北部凉山的边境人员也拒绝在中国新版护照上盖章，宁愿向中国入境者发放“另纸签证”。但越方表示中国公民仍可持此类护照正常入境越南。

我国的新版电子护照于今年5月15日启用，在新版护照上，除个人资料页、备注页等护照的功能页外，可印刷主题图案的页面共40页（即第8页至47 页），而在第8页的天安门图案上方，印有中国地图，地图包括“九段线”在内的南海，这张地图引起了菲律宾、越南等周边国家的关注。

《人民政协报》 2011年12月的报道指出，1947年，当时的国民政府内政部方域司印制了《南海诸岛位置图》。该图用11段国界线，圈定了中国南海海域范围，成为如今 中国坚持的南海主权九段线的来源。这条线又被称为传统疆界线，因其形状为“U”形，也被称为“U”形线。至此，南海领土范围在中国地图上明确化了。中华人 民共和国成立后，经政府审定出版的地图在同一位置上也标上这条断续线，只是在1953年将11段断续线去掉北部湾、东京湾2段，改为9段断续线。1958 年，中华人民共和国政府在其关于领海的声明中规定，领海宽度为12海里，并宣布此项规定适用于“中华人民共和国的一切领土，包括中国大陆及其沿海岛屿和同 大陆及其沿海岛屿隔有公海的台湾及其周围各岛、澎湖列岛、东沙群岛、西沙群岛、中沙群岛、南沙群岛以及其他属于中国的岛屿”。

2012年9月，南方周末网报道，中国向联 合国提交了中国钓鱼岛及其附属岛屿领海基点基线坐标表和海图。外交部指出，中国在1958年公布的关于领海的声明，确定了中国领海宽度为12海里。此次公 布的钓鱼岛领海基线，是根据在钓鱼岛及其附属岛屿上选定的17个领海基点划定的，从基线往外延12海里范围即为中国领海。

就菲律宾等国近日对中国新版护照做出的反应，中新网29日援引外交部发言人华春莹的回应称，“该类护照有关图案设计并非针对特定的国家，我们希望有关国家能够本着理性、克制的态度冷静地对待，以免对中外之间的正常人员往来造成不必要的干扰，中方也愿意同有关国家保持沟通，确保中外人员往来正常进行，并为他们提供便利。”

目前，菲律宾、越南都改用另纸签证的形式让中国公民入境，另纸签证是签证的一种形式，它和一般签注在护照上的签证具有同样的作用。区别在于，这是在护照以外单独签注在一张专用纸上，但必须和护照同时使用。

《北京晨报》11月24日援引中国驻越南大使馆工作人员的介绍称，目前越南方面对持新版中国护照的中国公民是通过另纸签证的方式让其入境，所以入境情况正常。

新版护照还新增了一些台湾著名景点的图片，在国台办28日举行的例行新闻发布会上，发言人杨毅就此回应称，“我们的立场、对台政策没有变化。两岸双方都应珍惜两岸关系迄今取得的进展和成果。”